现阶段，国内医院对污水处理的主要有两种方法：第1，利用消毒进行消毒之后将其排入市政下水道。第二，对污水采取生化处理并在消毒之后向自然水体中排放。这两种污水处理方式的主要特点表现在：首先，病原微生物浓度较高，单位对污水的消毒达不到合格标准。尤其大多医院在规模缩小、等级降低之后，其消毒方法、污水处理设备以及自我检测方面的完善程度也呈现递减趋势。其次，消毒过程中主要以氯为主。国内大多地区目标所采用的一般为一级或二级处理加氯消毒、次氯钠消毒或者利用氯、二氧化氯进行消毒。第三，消毒投加量过量或不足的情况比较常见。一部分医院为保证杀菌比较彻底，一体化污水处理设备公司，使用过量的消毒，也有部分医院为节约成本，投加量明显不足，达不到良好的消毒效果。
间歇式活性污泥法－混凝沉淀法
废水经格栅去除大的悬浮物后，进入调节池。使废水均质均量后。由污水泵提升进入SBR反应设备进行生化处理。处理后排人中间池。再经污水提升泵至反应沉淀池(采用泵前加药)。经固液分离后外排。生化污泥与沉淀污泥静压排入污泥浓缩池。经浓缩处理后，用污泥车外运作为肥料使用。浓缩池上清液回流至调节池重新处理。
